直播平台 李文均教授团队揭示细菌朱雀菌门的混合营养生活方式

微生物是地球上数量众多、形式多样的生命形式,它们在生态系统中扮演着重要角色。然而,由于传统分离培养技术的局限性,大多数微生物无法在实验室条件下进行分类培养,从而限制我们对其进行深入研究。随着高通量测序技术的快速发展,宏基因组学等免培养的微生物组学方法被广泛应用于微生物的研究,促使大量未培养微生物的发现。这些研究揭示了它们的生态功能和进化历史,扩展了我们对微生物生命的认知。其中,未培养细菌KSB1正是这样一类亟需深入研究的微生物。

 

本研究基于腾冲热泉的宏基因组数据和公共数据库中的MAGs,对KSB1的系统进行系统梳理,并将其命名为朱雀菌门(Zhuqueibacterota)。该门微生物归类于Fibrobacterota-Chlorobiota-BacteroidotaFCB)超门,揭示了其在全球范围的广泛分布及混合营养生活方式。研究表明,朱雀菌门微生物可能为兼性厌氧菌,能够以氢气作为电子供体,通过Calvin-Benson-BasshamCBB)循环进行化能自养,对热泉中的碳循环发挥着重要作用。本研究不仅深化了对朱雀菌门的理解,还强调了其在碳循环中的关键作用。通过祖先状态重建分析,我们推测朱雀菌门的祖先可能已具备兼性厌氧的生活方式,其碳固定能力可能是通过水平基因转移(HGT)获得的。这一成果为理解朱雀菌门的生态功能提供了新的视角,同时也为未培养微生物的分离培养研究提供了创新思路

 

1 朱雀菌门(Zhuqueibacterota)的系统发育(A)、生境分布、全球分布(B)与代谢模型(D

 

该研究成果以“Metagenomic analysis sheds light on the mixotrophic lifestyle of bacterial phylum Zhuqueibacterota的标题发表在《iMeta》学术期刊上。论文的第一作者是直播平台 博士生连政汉,李文均教授、刘兰助理研究员及焦建宇副研究员为共同通讯作者。同时,谭莎、袁洋、李蒙蒙、刘泽涛、胡超建、吕爱萍、欧阳玉婷、张靖宜、陈瑛、陈乐滨、罗振豪等共同参与了本研究。此外,印度国家农业食品生物技术研究所的Nimaichand Salam、中国科学技术大学的花正双教授、李昱娴博士后,以及浙江大学的马斌教授和卢彩玉博士也为本文的共同作者。该研究得到了国家自然科学基金等项目的资助。

 

2 朱雀菌门化能自养能力推断(ABC)与进化历史重构(DE